报关申请是二手机械设备进口报关的核心环节。进口商需要准备齐全相关单证，并按照规定的程序向海关申报。

　　进口商需要在运输工具申报进境之日起十四日内向海关申报，并提交纸质报关单和电子数据报关单。申报内容包括设备详细信息、成交价格及完税价格计算依据等。

　　海关将对申报内容进行审查，包括设备的真实性、完税价格的合理性等。完税价格由海关以成交价格为基础审查确定，若成交价格不能确定，海关将依法估定。

　　根据海关审查结果，进口商需要缴纳相应的关税、增值税等税费。税费缴纳是进口报关流程中不可或缺的一环。

　　进口商在收到海关的税费缴纳通知后，需要及时缴纳关税、增值税等税费。缴纳税费的方式包括现金缴纳、银行转账等。

　　如果海关对申报价格有疑问，可能会发出价格质疑或价格磋商通知单。此时，进口商需要及时补充申报货值证明材料，如保险凭证、付汇资料、设备运作原理、同类设备国内售价等，以便与海关早日确定完税价格。